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期刊論文
1. 齊茂吉，1986，〈五０代至六０代中共軍內衝突演變之研究〉《國立中央大學人文學報》，第5期，頁119-158。2. 齊茂吉，1987，〈關於研究中共軍隊的幾個問題〉，《國立中央大學人文學報》，第6期，頁99-126。
3. 齊茂吉，1991，〈評析大陸政策的形成－並兼論「國家統一綱領」的制定〉，《中華戰略季刊》，第80期，頁117-123。
4. 齊茂吉，1994，〈中共國防戰略意圖之探討及其影響〉，《中華戰略季刊》，第83期，頁71-90。
5. 齊茂吉，1995，〈毛澤東、彭德懷合作及衝突的軍事背景〉，《國立中央大學人文學報》，第13期，頁71-88。
6. 齊茂吉，1995，〈毛澤東與反右運動〉，《中華戰略季刊》，第84期，頁81-109。
7. 齊茂吉，2006，〈毛澤東欽定林彪為接班人之探討〉，《兩岸發展史研究》，第2期，頁199-227。
8. 齊茂吉，2006，〈五○年代毛澤東對臺灣問題的思考與轉變〉，《兩岸發展史研究》，創刊號，頁105-135。
9. 齊茂吉，2007，〈林彪與江青交惡之始末〉，《兩岸發展史研究》，第3期，頁125-163。
10. 齊茂吉，2008.6，〈毛澤東整肅林彪事件新探〉，《兩岸發展史研究》，第5期，頁169-224。
11. 齊茂吉，2009.12，〈「九一三事件」之新探〉，《兩岸發展史研究》，第8期，頁159-220。